国家重点实验室报告——RNA修饰的功能和调控机制的解析

2019年5月20日上午,应“蛋白质与植物基因研究国家重点实验室”伊成器研究员邀请,中山大学生命科学学院杨建华教授在吕志和楼B106为生科院师生做了题为《RNA修饰的功能和调控机制的解析》的学术报告。报告由伊成器研究员主持。

杨建华教授首先介绍了高通量测序技术给表观遗传学领域带来的机遇和挑战以及其团队为准确鉴定RNA修饰位点而建立的表观转录组学平台RMBase。之后,杨建华教授围绕非编码RNA介导的RNA修饰研究和组蛋白修饰介导的m6A修饰研究两个方面详细介绍了其团队的最新进展。其中,关于非编码RNA介导的RNA修饰研究部分,杨教授主要分享了其团队开发的用于预测和鉴定修饰的软件系统和测序技术,包括:(1)snoSeeker软件系统用来鉴定snoRNA介导的修饰位点;(2)RLT-seq测序技术大规模鉴定2’-O-Me修饰位点;(3)Dual-CLIP-seq技术和RRIscan软件鉴定snoRNA的靶标和修饰位点。在组蛋白修饰介导的m6A修饰研究方面,杨教授围绕“为什么只有特定区域的GGAC元件被精确地选择进行m6A修饰”的科学问题展开,讲述了其团队基于表观基因组和表观转录组的测序数据,发现组蛋白H3K36me3的分布模式与m6A的分布一致并且约60%的m6A位点与H3K36me3修饰位点重叠;而当去除H3K36me3能够导致m6A修饰水平发生全局性的降低。进而,通过大规模组学测序、信息学分析和实验研究揭示了METTL14能够直接识别组蛋白H3K36me3修饰,使m6A甲基转移酶复合物在转录延伸过程中介导了RNA上特定位置的m6A甲基化的机制。

在提问环节,杨建华教授就组织特异表达的snoRNA以及其介导的修饰、不同批次实验之间m6A信号的比较方法、如何减少在鉴定snoRNA的靶标和修饰位点的过程中所产生的假阳性,以及H3K36me3与METTL14如何在时间和空间上调控m6A的形成等具体问题与在场师生进行了深入讨论。